在欧联杯16强中，所有球队被分为了种子队和非种子队。种子队共有8支，全都是欧联杯小组赛时的小组第一。非种子队也是8支，这8个球队都是通过附加赛晋级的球队。在1/8决赛抽签中，将会遵循同国回避原则，种子队将享有先客后主的赛程优势。巴萨是本次欧联杯的最大夺冠热门，塞维利亚、皇家贝蒂斯这两支西甲劲旅也都打进了16强。

　　欧联杯16强

　　种子队：里昂（法国）、摩纳哥（法国）、莫斯科斯巴达（俄罗斯）、法兰克福（德国）、加拉塔萨雷（土耳其）、贝尔特莱德红星（塞尔维亚）、勒沃库森（德国）、西汉姆联（英格兰）

　　非种子队：巴塞罗那（西班牙）、塞维利亚（西班牙）、皇家贝蒂斯（西班牙）、格拉斯哥流浪者（苏格兰）、布拉加（葡萄牙）、莱比锡红牛（德国）、亚特兰大（意大利）、波尔图（葡萄牙）